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浅析sklearn中的数据预处理方法

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, l l+ b1 m7 j3 C6 j1 b

简介

9 \0 E; S& R( v8 L

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

( `& J) r6 {) i w, f$ H2 c

数据集准备

2 j% T& @9 |; a7 s. i) k

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

, F6 {7 ^9 R I( C, e1 I
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集% I s0 B+ X& e1 t T import numpy as np+ F! H8 \# y% E. m& A% w + f! @3 H& K p; N iris = load_iris() # 特征矩阵 3 _# y- O3 W0 X. l; B2 r. R print(iris.data.shape) # (150, 4) 3 H5 T1 O: |$ `" H! q5 I4 k; q( | print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]: k; l, @+ k% m# e$ G print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] 5 h: W& m1 w$ B" I1 h4 N; z
4 Z5 o( _( y8 G6 z

无量纲化

/ A, ]9 }- W" n8 O& Z: P

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

& g$ |6 O5 y& w! U1 _% `

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

; x2 X [6 y; Z9 F: `* e3 t- a7 ^

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

$ |, l; ]- w$ T4 [2 `+ ?

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

# y, W: i0 N& d7 t

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

* }7 n; g/ M0 x& b

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

6 k# W/ S) ~. F

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

, g: P& G: @. ]6 `3 P

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

& w) j" Z1 k$ c

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

; P4 n( z+ a9 W' I/ Q

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

- e/ \8 N& h+ B. ~0 y

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

9 K1 {" P( t# e/ [

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

; F: X7 F2 h$ U8 g9 j1 B' M! P
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 0 @. b5 o( |$ H6 D$ {' Q1 d6 O+ o4 H( c1 O # 标准化,返回值为标准化后的数据 1 m8 o3 x9 W) M, M3 @! L standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) : j( C2 _# q$ k" j print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]9 q8 f9 i3 Q; C$ u
0 u+ k% w; M( K& s% S* n/ c

归一化-区间缩放法

$ I( i" ` F( Z& ]% D- @' l- ^

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

5 c7 B8 O U$ k ~) J% b3 ^

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

: w8 ]9 w* ]& r! d, b" o

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

1 z6 h! w7 d: {7 i: v

常见用于神经网络。

2 @; d4 Q8 s6 @. }0 Z2 z1 @+ V

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

5 y0 M* N- z0 e
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 * I. X% n% V% q from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler * O% X$ D1 [3 y4 o, ^5 m! e+ S- s ~! M s* F5 L min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) Z3 v, P2 e0 _( a& x0 P2 P print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]4 b' W8 t( O" [! S" Y7 n
5 {9 e& p, {+ j8 `

正则化(Normalization)

; Q; F) p6 q7 @& R$ f$ n

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

8 n3 P4 E7 y) _9 D

常见用于文本分类和聚类。

7 R" P9 y; [$ s$ v( B) Z! g- D) V

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

: r' t, U8 w K4 V1 `- F: Q( ~

LpL_p范数的计算公式如下所示:

9 K! z) t( E+ H0 s4 u' v

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

8 N* S; \* U* d5 N6 H

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

; n1 w# |5 G V m/ u

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

9 H9 [1 Q$ r- f8 m- i( h" T

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

; \7 g) o) r/ U- U

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

* L! j# x; V5 u5 W
from sklearn.preprocessing import Normalizer+ x6 ~. }" T& A) q6 ]& n, B" e * J7 C* B D! h norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) # d% [) L0 d# t0 l9 A# a print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]1 w1 h+ F( }0 k9 ]. M1 {" L; m
w+ n9 }+ l" \

参数说明:

0 b: [3 Z) d1 k* r4 [$ b& `

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

5 L3 h+ s5 @: m) u: s, U

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

) A5 @* ~! j1 p4 G% v2 V! w" X

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

! o. |7 ~- b1 u: S( B) G

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

# q4 z* h& x% @& ]

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

7 @* y6 L% t- [" D9 q
from sklearn.preprocessing import Binarizer+ D1 w! p. f0 D" r, M& } l " c$ T4 |: T4 O% a" u # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 & I4 [. s' M! |0 o5 g binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)2 I0 y- P1 }# ?: X1 z! f9 l2 ]1 U print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]: U6 x/ x5 Q) s8 s4 E# W5 \0 M
2 Q C+ ^, H! p

对定性特征独热编码

' w" l% ^: y; c5 c! Z

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

& S$ @" Z( e; L6 o

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

- I: O1 T/ y8 _& s, r

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

; `% [! o4 H7 k2 G* Z
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 9 n A T% }- K& f" _ from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder ) m- `* W5 U O- N& t& L$ z import pandas as pd4 w9 S @1 C2 P6 d) C 8 T+ J( N6 }! {3 {- @, a, | print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)' t! m3 E' P6 ~) j one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)): I! z7 Q4 y w% T' `* D8 G3 d1 b print(one_hot.shape) # (150, 3)/ q8 C" g0 X: j0 A 4 l( z/ H5 j: y! e dummy = pd.get_dummies(iris.target)( G( V* y4 K; }2 Q: G. g6 g9 z print(dummy.shape) # (150, 3)- f! F9 D {/ w* T4 ]4 l! ?$ `
, k* n6 ^% G( O' }7 I

缺失特征值补全

, C* |6 a0 B9 m; r

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

! w% c$ w0 P! y! a) {6 i. I

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

! V( \2 K1 e6 J# t+ O6 W
from numpy import vstack, array, nan $ F7 [& Q3 l: S! E # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 3 \* F) R* Y I/ u. t) V from sklearn.impute import SimpleImputer " Y% N. H/ E5 Q! a6 D2 m: R% q - o9 Z* R# d/ h! P+ S # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN2 w2 ` a% w; x1 D0 B # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值): W3 y8 X) L4 ?* O imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") ' o& k' [( Y' q 0 @) z) d2 c6 S! J; ~5 g data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))# |) B- [' G8 \ print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] : Z9 T9 g$ c, k- v result = imputer.fit_transform(data) 1 V/ @3 k( r/ G1 r4 l print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]1 c- L- T/ O4 S
7 I; _4 m& a2 {

数据变换

3 H3 f) m+ c/ G" v

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

. ~: j$ s4 H% k" k# N- Q. D& W

基于多项式的数据变换

* m R ]4 N% Z" U' u- h( _- Y' a

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

( l' N7 u( I! g S

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

/ k* _2 e( r5 o; _9 B, z

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

4 [9 D6 |- ^( f6 |2 C. d! a" @0 T

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

0 n; Y, u' { Y- A% K+ T; \# ^
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换7 ^$ }, w: u) H; d. j. ] # 参数degree,默认值为2 i0 G5 C3 U4 a* } ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)/ V5 l+ q6 [* ~' Y, L print(ploy.shape) # (150, 15) / g7 y3 W. u" }* D print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]], M# a# i* Y4 g
: N8 a' g( ?9 c$ Q

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

* h' A+ X4 x0 N) v

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

; b; t' w/ a- c* A+ P+ [; ?

基于对数函数的数据变换

. v9 ^, N5 i0 a% o. a

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

( ]& t, c0 R$ |9 X% i/ g# v- A

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

) X$ j$ o. a; O0 ^4 Q
from numpy import log1p+ h2 ^1 w( t* P% p* g4 } from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer' e5 q! e9 [% R# d # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射6 S; r1 V k; n+ I4 }- | # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换* c S3 V9 V" L: r$ q # 第一个参数是单变元函数; r; o# o, K* |4 C log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) - F# V3 v0 |, ^ print(log_one.shape) # (150, 4)& B( ]7 @0 s# Q7 N9 {1 h print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]- Z: j* W- w/ r0 O) O# ~
' C5 Y0 A: S" D# ]0 B. d8 `/ J2 D

总结

! Q" x) |% W' W, E

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

: ~8 k6 y& f8 N0 S m% J1 D
. g' D% O) @. b9 c! }

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化- p5 u2 o' y; x# d6 p ! d, T! z7 {7 ?. W6 H; ~* C. G 4 y% ?* @# }+ G0 D4 F( _! x 4 {8 d) _7 \& t6 u7 } ( O, c+ Q: ~& E! n {* }' k- e
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