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浅析sklearn中的数据预处理方法

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7 h" d% B+ P- g6 b* C5 r

简介

# P0 N# g& E; i' A9 Q; p

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

/ f, g7 f$ x% |* p; d

数据集准备

$ |. s9 F6 D7 N: |5 Q

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

2 S4 z. `* J6 Q9 ^9 [7 x
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 " ~8 K& t. J- r import numpy as np : ~1 K2 R1 U9 n- k! K+ {4 O* k, M" C% W# i# ] iris = load_iris() # 特征矩阵& `2 @; T' d4 ]5 |7 k5 h print(iris.data.shape) # (150, 4)5 _: X! g/ r2 v5 r3 L print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]2 b1 f X; F) h% ^ print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]4 z. w( y1 ~' M0 c( Z/ J
: v, A9 F( S7 A% K4 c

无量纲化

9 f) E. `$ T' d# u! E, [& b+ O

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

! f& y/ I6 M( l4 R

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

+ `) |: b' J0 p) [

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

) q+ H7 L+ N. @* m- d5 }' v. N

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

( F4 i3 }: q8 U0 w9 S z- V

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

9 O9 {' N. p- _: Q

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

/ [, s9 ?2 |. {. Y1 v

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

1 q% a& r" H' j: l, I e

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

- V# l) J9 x/ c6 v F

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

$ x1 i/ g8 P* K! a- E% N

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

4 P! z3 m1 B0 {) s" _- q

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

+ k5 a r' u8 Q

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

( l: T: n1 l. D6 J1 m' n. ]
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 0 [1 {1 |# U% \0 }6 M ( y* h& o6 l, q2 ] I # 标准化,返回值为标准化后的数据. B7 s0 s/ O9 W standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) ; d Z& a* g% v3 G6 ~6 k print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] ' D! i/ j7 A$ _5 \3 }
4 p1 M, N. I u! U! F% m

归一化-区间缩放法

: O$ ]. U Z% {) @9 h% d. f

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

" k1 K* e" x' a- B, _# o$ \# l3 f

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

& C9 W! |# A/ y, `

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

* J3 @7 M! [2 ]) X5 Q X7 [; i

常见用于神经网络。

7 I& O" p! M* y7 q

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

* \: V$ X/ g1 Z+ z& {6 N$ b/ ]* m
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据. ?+ \1 r. T8 W5 K( |2 H* D from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler: j* n9 L/ C5 k9 r9 d 0 J+ ^% I/ X9 E min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data), A. \4 m5 j% |' p4 |8 N! V print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]6 v& q* ?# @1 ^4 Q2 \9 a
, e$ | s* W2 Y$ j

正则化(Normalization)

|+ o; f' c& N$ |* }9 E# R

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

2 C7 q& ^5 \8 V" R# |, Q

常见用于文本分类和聚类。

- H0 }% ~2 k8 [7 V' T

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

% j1 h+ S# R7 Z; t/ q+ [

LpL_p范数的计算公式如下所示:

9 E" Q, {/ o. M! c. q: l

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

" v) _/ {3 B9 s) m( S @

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

) Y6 n. A7 S6 D; F$ y! [

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

$ w( F9 A8 ~$ O

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

: K" [- \% [/ f; w

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

. _+ M% X( b% C8 l8 U
from sklearn.preprocessing import Normalizer" s# q u' ?- W0 h6 V, e8 K4 U 4 t! b0 _2 s& G( w1 B* F7 F$ } norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) " q. |. x# E% G+ P print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]" B1 e Z+ t. i6 _8 }
7 M) m! P3 \: _% j0 d$ r+ c( \& Q

参数说明:

# p3 ?/ F' p$ M: |

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

$ Y5 @8 i7 @* ?4 x7 }. g3 `

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

' y* {: ?( o; L2 G5 f8 P

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

' P' A+ b9 g/ C! G! t

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

+ t6 _* }( T( X0 R3 b0 K5 g

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

( O. `3 O" g6 f/ [$ Y# @9 M
from sklearn.preprocessing import Binarizer% d2 m g$ ]5 J4 c3 x: ?9 P 3 J" g3 F, R9 c& {1 c4 n # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 " j+ A3 M$ s3 u5 N' m2 `) s: G binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)! y+ u( D G' o4 g. U* e' q print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]3 M( b& F9 p; g- B4 ]+ \7 w4 D$ N
. S% h7 D+ D- O/ Z! R

对定性特征独热编码

/ u1 j3 I6 q4 [, m" O5 j& f

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

# h- \. Y9 `, @. L% K

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

4 F2 t6 o+ f2 \. l$ R

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

- R5 [8 b* l+ T' [. S* ]
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 # j& V5 K4 X1 f+ B from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder . m; q8 [4 J: D) t import pandas as pd% X$ m0 n* ^( Y1 V0 K9 m " E# j* }; E( z9 k* a5 f& X0 g print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) p$ N, E9 u4 N0 y1 H one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) ( U* Q# d% b0 o1 s8 X print(one_hot.shape) # (150, 3) + z( J& h- I# }& t+ y# q* K- T- a " Y5 P1 H k0 c- ~5 R dummy = pd.get_dummies(iris.target)' I- B, K! o& ?* I print(dummy.shape) # (150, 3) : A8 T8 G+ e1 M: s
. L0 M0 G; F1 R% P) Z& e

缺失特征值补全

l5 @1 C; R8 w- `: n' B5 G9 _( Z) z0 u3 C

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

s. I4 I# l$ L3 ~

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

- Z7 q8 t0 z ^0 C) [
from numpy import vstack, array, nan 2 l/ j$ S4 Q) _+ k1 O' d # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据* _( ?0 K# h- A from sklearn.impute import SimpleImputer! x9 k/ u1 l- Y/ j5 J ; O9 h" u/ H0 H # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN - Q% d `- o, g- u' `5 q$ {, i # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)3 [6 G/ F8 O) T7 a* M+ X imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")" k; X6 K _; Z- { ( }' D0 n4 Y* U data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) 6 F0 s5 ]. ]/ ~/ s/ s print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] 8 |1 x: u% h* }9 U result = imputer.fit_transform(data) + a, p4 _* G( q$ `9 v, n print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]0 H* v8 c- j6 G! T1 s) h
6 F1 R/ y2 e% p! Y) j

数据变换

6 E6 J! z) W+ `

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

4 g4 B% h" U, z( i) v: u

基于多项式的数据变换

( [! `& m; v# o7 O. W4 P

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

) o* w" C' y! Q/ ~/ M

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

4 d2 ^- N4 Y4 c7 R

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

) `, G8 l4 `# }5 Y- m8 a$ w

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

+ `! i5 N& {. C: _2 _4 \; v4 [
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换/ Q& ^$ T# p) h( O! k/ N # 参数degree,默认值为2' }. l( A- a( E- s4 g5 ` ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) 6 H& H" m1 S& ? print(ploy.shape) # (150, 15) , i5 m, K2 G ^! { ` print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]6 ~6 n& }7 w0 S$ W" g: y- S* n
' H8 X, c) c1 k% I# D& g% z

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

' L7 e7 R# s `+ S

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

5 L! N$ v: K$ }

基于对数函数的数据变换

2 k) _. X5 g: n1 v6 B9 ~

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

9 c# ~- j% K/ B9 o7 k

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

- ~1 B1 g" X# K) k' R; O4 y# Q. L
from numpy import log1p3 S% T; O2 m, e _7 k9 r* L from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer( p. \* R1 N! W' j; v1 E, b # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射4 {/ r: Y! P" K. j& w. J # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 " x: Y, ]$ ]( v b # 第一个参数是单变元函数1 f8 p; ]. y8 z log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)' C0 q" j! B$ l \0 h print(log_one.shape) # (150, 4)0 X2 X4 G/ ?) M u print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]1 M: a5 `9 i+ ~* c% p# E
2 z/ e6 X- S j: Y: m( G

总结

6 T& E2 W' y6 q) o( Y

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

4 U7 F1 e* L) g+ u' M% J$ }! A4 x
. |% h) q* ?1 C: M! f' \

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化+ \8 J: L$ ~6 K" C; F% v; Y b ; i* N$ r6 N9 e+ m. t' K , T- o) d' N' [( K $ x: X" ~ O+ r+ j! y2 _: { & ^/ f0 r0 R) E: u0 i3 c0 \
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